Différence entre le cosmide et le phagemide

le différence clé entre Cosmid et Phagemid est sur le type de séquences qu'il contient. Un cosmide contient un site cos et un plasmide. Il s’agit donc d’un vecteur hybride alors qu’un phagémide est un plasmide contenant une origine de réplication F1 du phage F1..

Les cosmides et les phagémides sont utilisés à des fins de clonage, en particulier pour cloner de plus gros fragments d'ADN. Ceux-ci sont largement utilisés notamment dans le clonage de gènes responsables de la production de diverses protéines. Les cosmides et les phagemides sont soit répliqués seuls sous forme de plasmides, soit emballés dans des particules virales, puis répliqués..

CONTENU

1. Vue d'ensemble et différence clé
2. Qu'est-ce qu'un cosmide?
3. Qu'est-ce qu'un phagemide?
4. Similitudes entre le cosmide et le phagemide
5. Comparaison côte à côte - Cosmid vs Phagemid en forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce qu'un cosmide??

Un cosmide, appelé plasmide hybride, comprend des sites cos extraits de particules de phage Lambda et un plasmide. Ces sites cos sont de longs fragments d'ADN avec 200 paires de bases. Par conséquent, ils ont des extrémités cohésives ou collantes qui permettent au plasmide de s’intégrer dans l’ADN viral. Par conséquent, les sites cos sont essentiels pour le conditionnement de l'ADN.

Il y a trois sites cos;

  • Site cosN - impliqué dans la coupure du brin d'ADN par l'activité de la terminase
  • site cosB - engagé dans la tenue de la terminase.
  • Site cosQ - impliqué dans la prévention de la dégradation de l'ADN par les DNases.

Figure 01: cosmide

En outre, les cosmides peuvent répliquer l'ADN simple brin ou l'ADN double brin en utilisant une origine de réplication appropriée. Les cosmides contiennent généralement des gènes de résistance aux antibiotiques en tant que marqueurs pour la sélection des transformants. Ainsi, l’utilisation d’un cosmide comme vecteur peut faciliter le clonage et la digestion du vecteur par enzyme de restriction peut ensuite extraire ces fragments..

Qu'est-ce qu'un phagemide (Phasmid)?

Phagemid, aussi appelé Phasmid, est aussi un type de vecteur hybride. Phagemid contient une origine de réplication spéciale appelée origine de réplication f1. L'origine f1 de réplication extraite d'un phage f1.

Le phagémide peut répliquer l'ADN simple brin et double brin. La réplication peut être réalisée sous forme de plasmide pendant la réplication indépendante ou peut être emballée dans des particules de phage et finalement infecter un hôte bactérien. E. coli. Lors de l'infection du E. coli cellules, le phage f1 nécessite la présence d’un pilus. Par conséquent, les pili de sexe sont importants pendant in vitro conditionnement des phagémides.

Quelles sont les similitudes entre Cosmid et Phagemid?

  • Cosmid et Phagemid sont des vecteurs de clonage utilisés dans la technologie de l’ADN recombinant.
  • Le cosmide et le phagémide peuvent répliquer l'ADN simple brin et double brin.
  • Les deux peuvent subir une réplication indépendante semblable aux plasmides.
  • Le cosmide et le phagémide peuvent subir in vitro conditionner et infecter les cellules bactériennes.
  • Cosmid et Phagemid nécessitent tous deux une origine de réplication appropriée pour le clonage.

Quelle est la différence entre le cosmide et le phagemide?

Cosmid vs Phagemid

Cosmid est un vecteur hybride qui contient un site cos et un plasmide. Le phagémide est un plasmide contenant une origine de replication du phage F1..
 Présence de Sites Cos
Les sites Cos sont présents dans les cosmides et sont nécessaires au conditionnement in vitro.. Les sites Cos sont absents chez le phagemide.
 Présence de l’origine F1 de la réplication
Dans les cosmides, l’origine de la réplication peut être présente ou non. L'origine de réplication de F1 est présente dans le phagemide.
Présence de gènes résistants aux antibiotiques
Des gènes résistants aux antibiotiques sont présents dans les cosmides pour identifier les transformants à partir de non-transformants.. Les gènes résistants aux antibiotiques sont absents chez les phagémides.
Condition d'emballage in vitro
Nécessite un site cos. Nécessite un pilus sexuel.

Résumé - Cosmide vs Phagemide

Cosmid et Phagemid sont des vecteurs de clonage utilisés dans la technologie de l'ADN recombinant. Les cosmides sont des vecteurs hybrides qui contiennent des extrémités collantes spéciales appelées sites cos.. in vitro l'emballage nécessite ces sites cos. Les phagémides sont des plasmides contenant une origine de réplication f1 extraite du phage f1. Le cosmide et le phagemide peuvent tous deux subir une réplication ou une in vitro emballage aux cellules bactériennes. Ce sont les différences importantes entre le cosmide et le phagemide.

Référence:

1.Qi, H et al. «Vecteurs phagémides pour l'affichage des phages: propriétés, caractéristiques et construction.» Journal of Molecular Biology., Bibliothèque nationale de médecine des États-Unis, 30 mars 2012.. Disponible ici 
2.Collins, J et B Hohn. «Cosmids: un type de vecteur de clonage de gène plasmidique qui peut être conditionné in vitro sous des têtes de Bacteriophage Lambda.» Actes de l'Académie nationale des sciences des États-Unis d'Amérique, Bibliothèque nationale de médecine des États-Unis, septembre 1978. Disponible ici  

Courtoisie d'image:

1.'Cosmid (anglais) 'de Zlir'a (CC0) via Wikimedia Commons