Différence entre l'ADN en amont et en aval

Différence clé - ADN en amont et en aval
 

Il est important d'avoir une connaissance générale de la composition et de la structure de l'ADN afin de comprendre la différence entre l'ADN en amont et en aval. L'ADN est composé de chaînes polynucléotidiques. Les nucléotides sont les éléments constitutifs qui créent les chaînes polynucléotidiques et chaque nucléotide est constitué de trois composants: un sucre à cinq carbones, une base azotée et un groupe phosphate. Un groupe phosphate et un groupe OH sont liés aux atomes de carbone en position 5 'et en carbone 3' de la molécule de sucre dans un nucléotide, respectivement. Les nucléotides sont reliés entre eux par des liaisons phosphodiester formées entre le groupe phosphate en 5 'd'un nucléotide et le groupe OH en 3' du nucléotide adjacent. Si une chaîne polynucléotidique a un groupe phosphate en 5 'libre, elle est désignée par l'extrémité 5'; s'il a un groupe OH 3 'libre, il est attribué à une extrémité 3'. Par conséquent, les brins d'ADN ont généralement des extrémités 5 'et 3' en fonction des positions extrêmes des chaînes polynucléotidiques. L'ADN existe également sous forme double brin. Deux brins sont antiparallèles l’un à l’autre. Par conséquent, l'ADN a deux brins qui vont dans la direction de 5 'à 3' et de 3 'à 5'. L'ADN en amont et en aval est référé en référence à la transcription et à la synthèse du brin d'ARNm 5 'à 3'. Si l'ADN est considéré vers l'extrémité 5 du brin codant à partir du site d'initiation de la transcription, il est appelé ADN en amont. Si l'ADN est considéré vers l'extrémité 3 'du brin codant depuis le site d'initiation de la transcription, on parle d'ADN en aval. C’est la principale différence entre l’ADN en amont et en aval..

CONTENU
1. Vue d'ensemble et différence clé
2. Qu'est-ce que l'ADN en amont?
3. Qu'est-ce que l'ADN en aval?
4. Comparaison côte à côte - ADN amont / aval
5. Résumé

Qu'est-ce que l'ADN en amont??

Un gène est une hérédité d'unité structurelle et fonctionnelle située sur l'ADN d'un organisme. Il est stocké avec des instructions pour construire une protéine. Le gène a une région spécifique d'une molécule d'ADN. Si nécessaire, il se transcrit et se transforme en une protéine via la synthèse d'un brin d'ARNm. Normalement, un brin codant du gène va de 5 'à 3'. Quand il est transcrit, il produit un brin d'ARNm dans la même direction 5 'à 3'. Au cours de la transcription, un brin antisens 3 'à 5' sert de brin matrice et initie la synthèse d'ARNm. Il existe un site d'initiation de la transcription dans le gène. En référence au site d'initiation de la transcription, la région d'ADN vers l'extrémité 5 'du brin codant est connue sous le nom d'ADN en amont. Un promoteur du gène est normalement situé dans la région en amont de l'ADN. Dans les gènes eucaryotes, il y a des boîtes TATA, des éléments promoteurs proximaux et des amplificateurs dans la zone en amont du gène. La région en amont du gène est référencée avec des nombres négatifs. L'ADN en amont d'un gène est de la plus haute importance pour la transcription.

Qu'est-ce que l'ADN en aval??

Le site d'initiation de la transcription est appelé +1 point d'un gène. La région de l'ADN à partir de +1 point vers l'extrémité 3 'du brin codant est appelée ADN en aval. En d'autres termes, en aval du gène se situe du site d'initiation de la transcription vers l'extrémité 5 'du brin matrice. Par conséquent, l'ADN en aval d'une région de gène comprend une unité de transcription et d'autres séquences telles qu'une séquence de terminateur. Le promoteur peut influencer la séquence en aval d'un gène. La partie aval d'un gène est référée avec des nombres positifs. L’ADN aval d’un gène est la région réelle qui donne le produit protéique.

Figure 01: ADN amont et aval

Quelle est la différence entre l'ADN amont et aval?

ADN amont / aval
La région de l'ADN vers l'extrémité 5 'de la séquence codante à partir du site d'initiation de la transcription est connue sous le nom d'ADN en amont.	La région de l'ADN vers l'extrémité 3 'du brin codant à partir du site d'initiation de la transcription est connue sous le nom d'ADN en aval.
Éléments
Les promoteurs et les activateurs sont situés sur l'ADN en amont	L'unité de transcription et les séquences de terminaison sont situées dans l'ADN en aval.
Numérotage
Les nucléotides dans la région en amont sont référencés avec des nombres négatifs	Les nucléotides sont référencés avec des nombres positifs.
Une fonction
Cette région contient les éléments nécessaires pour réguler et initier la transcription	Cette région contient des instructions pour produire une protéine et terminer la transcription

Résumé - ADN en amont et en aval

Il est facile d'identifier en amont et en aval d'un brin d'ARN. En ce qui concerne le site de référence, la région située à l'extrémité 5 'du brin d'ARN est appelée ARN amont, tandis que la région située à l'extrémité 3' est appelée ARN aval. Cependant, dans l'ADN, il y a deux brins qui vont dans les deux sens 5 'à 3' et 3 'à 5'. Par conséquent, la différence entre l'ADN en amont et en aval est compliquée. Par conséquent, il est différencié en référence à la transcription d'un gène. Du site d'initiation de la transcription vers l'extrémité 5 du brin sens, la région d'ADN est appelée ADN en amont, tandis que du site d'initiation de la transcription vers l'extrémité 3 'du brin sens est appelée ADN en aval. C'est la différence entre l'amont et l'aval de l'ADN.

Références:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi et Jonatha M. Gott. «Rôles distincts pour les séquences en amont et en aval des sites Physarumediting.» ARN. Cold Spring Harbor Laboratory Press, septembre 2009. Web. 18 mars 2017

Courtoisie d'image:
1. Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro et Luísa Romão. «Régulation de l'expression des gènes par les cadres de lecture ouverts en amont et les maladies humaines.» PLOS Genetics. Bibliothèque publique des sciences, n.d. Web. 18 mars 2017.